A generalidade dos autores refere que a igreja foi construída nos finais do século XV ou nos inícios de XVI - altura em que o manuelino se afirmava -, acrescentando, no entanto, um dos investigadores locais, na sua obra "Santa Casa da Misericórdia de Santiago do Cacem", que foi a família Estaço, nomeadamente João Estaço, quem a fundou, embora não o fizesse sozinho mas na companhia de outras famílias da vila.

Em 1678, o templo sofre a sua primeira reedificação pela mão do provedor Cristovão de Brito Varela -conforme a inscrição colocada num dos arcos botantes-, seguindo-se-lhe uma outra, após o terramoto de 1755, pela mão do provedor Miguel Inácio Falcão Beja, que para o efeito, empenhou todos os seus bens. Em 1895, a igreja incêndiou-se, porém, tal facto não trouxe modificações importantes para o templo.

No conjunto da sua frontaria, onde antigamente estava situada a antiga capela-mor manuelina, que foi invertida com a reconstrução do século XVIII, destaca-se o alto portal e o janelão barroco - em cuja verga foi colocado um medalhão com as cinco chagas de Cristo -, a par da desenvolvida e larga escadaria de acesso, lajeada com vários fragmentos de lápides sepulcrais. Noutro local, nomeadamente no seu alçado lateral esquerdo foram construídos três interessantes arcos botantes, dois dos quais servindo de moldura a um pequeno portal manuelino, sem esquecer o exterior da capela-mor, onde também se pode observar um lintel manuelino, sobrevivente do terramoto.