Esta capela foi edificada no séc. XVII e encontra-se junto do Convento de Santo António. A sua fachada é bastante simples, em forma de pentágono largo, com forte cunhal, uma cornija angular encimada por uma cruz e duas janelas que ladeiam um nicho (vazio) com decoração barroca sobre a porta. No seu alinhamento encontra-se a fachada da casa do despacho, com uma porta baixa sob janela de sacada. Cruzeiros da Via Sacra rodeiam a capela e a casa do despacho. O interior da capela é composto por uma nave com abóbodas de aresta em tijolo, pintadas com composições vegetalistas estilizadas. Na capela-mor encontra-se um retábulo com elementos barrocos, da época de D. Pedro II, o qual enquadra um baixo-relevo de grandes dimensões, representando S. Francisco recebendo os Estigmas, ladeado por belas esculturas e por um outro baixo-relevo que assinala o Papa entregando a regra franciscana. As linhas de composição do retábulo têm continuidade nas paredes laterais e o arco triunfal, de barroco mais avançado, está coroado por uma grande sanefa, com motivos ornamentais que se repetem nas sanefas sobrepostas ao púlpito e aos altares laterais. As paredes encontram-se revestidas por painéis de azulejos setecentistas da oficina dos Rifarto, Coimbra, com figuras de eremitas, encontrando-se limitados por talhas douradas com pilastras coríntias assentes numa bancada corrida, parecendo continuar o retábulo.