Pastor protestante, depois de concluir os estudos de Medicina transferiu-se em 1913 para a África Equatorial Francesa (Gabão), onde construiu, nas margens do rio Ogoué, um hospital para doenças tropicais e a clínica para leprosos Lambaréné, que desenvolvia uma intensa atividade médica e missionária.
Durante a Primeira Guerra Mundial, foi encarcerado pelas tropas francesas e, em 1924, regressou a Lambaréné. Recorrendo a conferências, a concertos de órgão (era um especialista em Bach) e aos dividendos obtidos com seus livros, conseguiu financiar as instalações.
Schweitzer tornou-se uma figura lendária devido à sua atividade solidária.
No campo teológico dedicou-se à investigação sobre a vida de Jesus.
Em 1951 recebeu o Prémio da Paz outorgado pelos livreiros alemães e, em 1952, o Prémio Nobel da Paz.